学院始建于1958年，前身为吉林省农业机械化学校，2001年经吉林省政府批准、教育部备案，成立吉林工程职业学院。2007年，学校成为国家技能紧缺型人才培养项目汽车维修工专业授权学校。
学院下设汽车工程系、农业工程系、生物工程系、计算机系、管理系、基础部和继续教育部等8个教学单位。开设了50个高职专业，涉及工、农、管、经、文等四大门类，其中汽车检测与维修技术专业为中央财政支持建设专业，汽车技术服务与营销专业为吉林省特色专业。
学院拥有一支师德高尚、技艺精湛、治学严谨的高素质教师队伍，其中专任教师302人，具有副高级以上职称的教师117人，硕士学位以上教师165人。还聘有来自行业、企业一线的技术专家和能工巧匠40余人担任学院的兼职教师。
学院拥有先进的教学和实验实训条件，图书馆藏书40余万册，报刊杂志800余种，建有现代化的教学楼、实验实训楼、体育馆、学生公寓及学生餐厅等基础设施。拥有汽车实训中心、农业实训中心、经济管理实训中心、机械实训中心等4个实训中心和67个实训实验室。
学院高度重视毕业生就业工作，不断加强以职业能力培养为主要内容的就业指导和服务工作，形成了以学院总部为中心，各系部结合的专业实习基地网络体系。近年来，学院不断拓宽毕业生就业渠道，完善毕业生就业推荐制度，通过各种途径为毕业生寻求就业机会，以实现人才培养和使用的对接。学院积极组织供需见面会，邀请企事业单位来校招聘毕业生，为学生就业搭建平台。学院还积极开展就业跟踪服务工作，建立了毕业生就业跟踪调查系统，定期对毕业生进行跟踪调查，及时掌握毕业生的就业状况和用人单位对学院人才培养的反馈意见，为学院教育教学改革提供依据。
