医师资格证红本和绿本的区别如下：

1. 颜色区别：医师资格证红本和绿本最直观的差别是封面颜色不同，红本封面为红色，绿本封面为绿色。
2. 内容区别：内页内容也有所区别，医师资格证红本主要内容包括医师资格认定通知、考试成绩单、授予医师资格证明、执业印章等，而绿本则增加了医师执业证书号以及证书登记表。
3. 使用范围：由于两者侧重点不同，因此红本和绿本的使用范围也有所不同。例如，红本可以在企事业单位办理入职手续时使用，而绿本则可以用于购买汽车时办理过户手续。
4. 法律效力：医师资格证是医学界的从业者通过考试取得的资格，代表着医师的理论基础和学术水平。不同国家的规定有所不同，但在中国，医师资格证是衡量医生专业水平的重要标志之一。

综上所述，医师资格证红本和绿本在颜色、内容、使用范围和法律效力等方面都存在差异。具体使用哪个证书需要根据具体情况而定。