蓝本和红本是医师资格证的两个不同版本，它们之间的区别主要体现在以下几个方面：

1. 颁发机构：蓝本由国家卫生健康委员会颁发，而红本则由国家中医药管理局颁发。
2. 使用范围：蓝本适用于综合医院、妇幼保健院、卫生院、社区卫生服务中心等医疗机构，而红本则适用于中医科、民族医学科等医疗机构。
3. 印刷颜色：蓝本为蓝色封面，而红本则为红色封面。
4. 考试类型：蓝本考试类型为西医类别，而红本考试类型为中医类别。
5. 考试科目：蓝本考试科目包括西医临床医学的基础理论、基础知识和基本技能等，而红本考试科目包括中医临床医学的基础理论、基础知识和基本技能等。
6. 适用对象：蓝本适用于西医临床医学专业的人员，而红本适用于中医临床医学专业的人员。

总之，蓝本和红本都是医师资格证的合法版本，但在不同的医疗机构和不同的专业领域具有不同的适用范围和考试类型。选择使用哪种证书应根据个人情况和实际需要来决定。