四川中医药高等专科学校最好的专业是根据学校的学科发展规划、市场需求和教学质量评估结果综合确定的。在2022年教育部公布的学校专业评估结果中，学校的中药学、针灸推拿、中医养生保健、中医骨伤、中医康复技术、中医美容等专业被评定为A+等级，这表明这些专业在教学质量和学科实力方面具有很高的水平。

中药学专业是学校的特色专业之一，具有多年的办学历史和优秀的师资队伍，教学设施先进，实验设备完善，并与多家知名药企建立了校企合作关系，为学生提供了丰富的实践机会和就业渠道。针灸推拿专业是学校的重点发展专业，教学水平高超，拥有一支经验丰富的师资队伍和先进的教学设备，毕业生就业率一直保持在95%以上。中医养生保健专业是学校新兴的特色专业，紧密结合市场需求，教学内容丰富多样，学生毕业后可以从事中医养生保健行业的相关工作。

总之，四川中医药高等专科学校在中药学、针灸推拿、中医养生保健、中医骨伤、中医康复技术、中医美容等专业方面拥有很高的教学水平和学科实力，为广大学子提供了良好的学习和发展平台。