1. 南通大学（Nantong University）
南通大学是南通市的一所公立综合性大学，创建于1999年，由南通师范高等专科学校、南通工学院、南通医学院等三所学校合并而成。学校现有四个校区，设有35个学院和16个研究机构，涵盖了文、理、工、医、管、法、教育、艺术等多个学科门类。
2. 东南大学（Nantong branch of Southeast University）
东南大学南通校区是东南大学的一个分校区，位于南通市。东南大学是中国著名的综合性大学之一，起源于1920年创立的国立东南大学。南通校区主要侧重于工科、理科和医学等专业的培养。
3. 江苏科技大学（Jiangsu University of Science and Technology）
江苏科技大学是一所工科为主的综合性大学，位于江苏省镇江市。2012年，学校为了更好地适应办学规模的需要，将原镇江医学院并入本校。学校设有18个学院和1个系，涵盖了理、工、文、管、经、法、教育、医等8个学科门类。
4. 江苏航运职业技术学院（Jiangsu Maritime Vocational and Technical College）
江苏航运职业技术学院是一所公办的全日制高等职业院校，位于南通市。学校设有10个二级学院和3个教学部，开设了50多个专业。
5. 江苏工程职业技术学院（Jiangsu Vocational and Technical College of Engineering）
江苏工程职业技术学院是一所公办的全日制高等职业院校，位于南通市。学校设有10个二级学院和3个教学部，开设了50多个专业。
6. 南通理工学院（Nantong Polytechnic）
南通理工学院是一所民办普通本科院校，位于南通市。学校设有10个二级学院和2个教学部，开设了30多个专业。
7. 南通科技职业学院（Nantong Science and Technology Vocational College）
南通科技职业学院是一所公办的全日制高等职业院校，位于南通市。学校设有8个二级学院和4个教学部，开设了30多个专业。
