赤峰学院有22个学院、17个系，开办54个本科专业，102个专科专业。学校设有蒙古族师范学院、蒙古语文学院、历史文化学院、数学与统计学院、物理学与电子信息工程学院、化学与环境工程学院、能源工程学院、机械工程学院、体育学院、美术与设计学院、音乐学院、计算机科学与技术学院、文法学院、外语学院、教育科学学院、财经学院、工商管理学院、健康科学学院、马克思主义学院、基础医学院、临床医学院、公共卫生与健康学院、远程教育学院等。

其中，最著名的几个学院是历史文化学院，它是赤峰学院的二级学院，前身为赤峰师范学校，1981年改建为昭乌达蒙族师范高等专科学校，2001年赤峰师范学校、赤峰教育学院、内蒙古蒙文专科学校并入；基础医学院，由原昭乌达蒙族师范高等专科学校的医学基础课部和赤峰卫生学校的基础医学部分合并组建；物理科学与电子信息工程学院，由原昭乌达蒙族师范高等专科学校的物理系和赤峰教育学院的物理教研室于2002年合并组建；财经学院，源于1958年成立的昭乌达师范专科学校财经班，1985年成立经济系，2001年更名为财经系，2003年更名为经济与管理系，2016年更名为财经学院。

总的来说，赤峰学院的学科门类较为齐全，涵盖了文、理、工、法、教育、历史、艺术等多个领域，是一所综合性大学。