青海省高考539分能报考的大学可能会有所不同，因为每个大学的录取分数线和招生情况可能会有所不同。但是，一般来说，539分可以报考一些普通的本科院校，例如青海民族大学、青海师范大学、青海大学等。

而青海省高考556分可以报考的大学则相对更好一些，可以报考一些知名的大学，例如南京大学、厦门大学、山东大学等。当然，具体还要根据每个大学的录取分数线和招生情况来决定。

总的来说，高考成绩只是一个参考，选择适合自己的大学才是最重要的。建议考生在报考前认真了解每个大学的招生政策和录取标准，以便做出更好的选择。