甘肃省理科高考成绩为409分的学生，可以尝试报考一些三本大学。以下是一些可能适合的大学：

1. 兰州城市学院
2. 河西学院
3. 陇东学院
4. 河西民族学院
5. 甘肃民族师范学院

以上这些大学都是甘肃省内较为知名的本科院校，它们在师资力量、教学设施、校园环境等方面都有一定的优势，可以为学生的成长提供良好的学习环境。当然，具体选择哪所大学还需要根据学生的个人情况和兴趣爱好来决定。